Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf394Q9Z1D9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf394Q9Z1D9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf394Q9Z1D9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf394Q9Z1D9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf394Q9Z1D9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf394Q9Z1D9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf394Q9Z1D9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf394Q9Z1D9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf394Q9Z1D9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf394Q9Z1D9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf394Q9Z1D9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf394Q9Z1D9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf394Q9Z1D9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf394Q9Z1D9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Znf394Q9Z1D9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms