Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cog1Q9Z160 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cog1Q9Z160 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cog1Q9Z160 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog1Q9Z160 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog1Q9Z160 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms