Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cpne6Q9Z140 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne6Q9Z140 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne6Q9Z140 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne6Q9Z140 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne6Q9Z140 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms