Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pard6aQ9Z101 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pard6aQ9Z101 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6aQ9Z101 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6aQ9Z101 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pard6aQ9Z101 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms