Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skp2Q9Z0Z3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skp2Q9Z0Z3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Skp2Q9Z0Z3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skp2Q9Z0Z3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms