Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NgfrQ9Z0W1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NgfrQ9Z0W1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NgfrQ9Z0W1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NgfrQ9Z0W1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NgfrQ9Z0W1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NgfrQ9Z0W1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NgfrQ9Z0W1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NgfrQ9Z0W1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NgfrQ9Z0W1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NgfrQ9Z0W1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NgfrQ9Z0W1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms