Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gipc1Q9Z0G0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gipc1Q9Z0G0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gipc1Q9Z0G0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gipc1Q9Z0G0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gipc1Q9Z0G0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gipc1Q9Z0G0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gipc1Q9Z0G0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms