Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChrdQ9Z0E2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChrdQ9Z0E2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChrdQ9Z0E2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ChrdQ9Z0E2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChrdQ9Z0E2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChrdQ9Z0E2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChrdQ9Z0E2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChrdQ9Z0E2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ChrdQ9Z0E2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ChrdQ9Z0E2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ChrdQ9Z0E2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ChrdQ9Z0E2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChrdQ9Z0E2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChrdQ9Z0E2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms