Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srd5a3Q9WUP4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srd5a3Q9WUP4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srd5a3Q9WUP4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srd5a3Q9WUP4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srd5a3Q9WUP4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srd5a3Q9WUP4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms