Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTL2

Rab25, Ras-related protein Rab-25, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab25Q9WTL2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab25Q9WTL2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab25Q9WTL2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab25Q9WTL2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab25Q9WTL2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab25Q9WTL2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab25Q9WTL2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab25Q9WTL2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab25Q9WTL2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab25Q9WTL2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab25Q9WTL2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab25Q9WTL2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab25Q9WTL2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab25Q9WTL2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab25Q9WTL2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab25Q9WTL2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab25Q9WTL2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab25Q9WTL2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab25Q9WTL2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab25Q9WTL2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab25Q9WTL2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab25Q9WTL2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab25Q9WTL2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms