Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PplQ9R269 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PplQ9R269 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PplQ9R269 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PplQ9R269 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PplQ9R269 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PplQ9R269 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PplQ9R269 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PplQ9R269 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PplQ9R269 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PplQ9R269 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PplQ9R269 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PplQ9R269 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PplQ9R269 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PplQ9R269 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PplQ9R269 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PplQ9R269 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PplQ9R269 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PplQ9R269 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PplQ9R269 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PplQ9R269 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PplQ9R269 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PplQ9R269 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PplQ9R269 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PplQ9R269 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PplQ9R269 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PplQ9R269 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PplQ9R269 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PplQ9R269 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PplQ9R269 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PplQ9R269 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PplQ9R269 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PplQ9R269 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PplQ9R269 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PplQ9R269 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PplQ9R269 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PplQ9R269 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PplQ9R269 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PplQ9R269 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PplQ9R269 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PplQ9R269 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PplQ9R269 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PplQ9R269 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PplQ9R269 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PplQ9R269 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PplQ9R269 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PplQ9R269 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PplQ9R269 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PplQ9R269 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PplQ9R269 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PplQ9R269 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
PplQ9R269 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PplQ9R269 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PplQ9R269 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PplQ9R269 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PplQ9R269 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PplQ9R269 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms