Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TapbpQ9R233 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TapbpQ9R233 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TapbpQ9R233 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TapbpQ9R233 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TapbpQ9R233 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TapbpQ9R233 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TapbpQ9R233 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TapbpQ9R233 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TapbpQ9R233 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TapbpQ9R233 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TapbpQ9R233 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TapbpQ9R233 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TapbpQ9R233 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TapbpQ9R233 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TapbpQ9R233 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TapbpQ9R233 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TapbpQ9R233 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TapbpQ9R233 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TapbpQ9R233 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TapbpQ9R233 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TapbpQ9R233 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms