Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubd1Q9R1K7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubd1Q9R1K7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubd1Q9R1K7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubd1Q9R1K7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubd1Q9R1K7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubd1Q9R1K7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubd1Q9R1K7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubd1Q9R1K7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubd1Q9R1K7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms