Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trex2Q9R1A9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trex2Q9R1A9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trex2Q9R1A9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trex2Q9R1A9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trex2Q9R1A9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms