Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M4

Podxl, Podocalyxin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PodxlQ9R0M4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PodxlQ9R0M4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PodxlQ9R0M4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PodxlQ9R0M4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PodxlQ9R0M4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PodxlQ9R0M4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms