Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb1bp2Q9R000 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb1bp2Q9R000 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb1bp2Q9R000 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb1bp2Q9R000 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb1bp2Q9R000 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb1bp2Q9R000 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb1bp2Q9R000 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb1bp2Q9R000 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb1bp2Q9R000 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb1bp2Q9R000 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb1bp2Q9R000 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb1bp2Q9R000 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb1bp2Q9R000 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb1bp2Q9R000 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms