Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZN3

Fbxo8, F-box only protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo8Q9QZN3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo8Q9QZN3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo8Q9QZN3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo8Q9QZN3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo8Q9QZN3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo8Q9QZN3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo8Q9QZN3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo8Q9QZN3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms