Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
Usp21Q9QZL6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Usp21Q9QZL6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Usp21Q9QZL6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Usp21Q9QZL6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Usp21Q9QZL6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Usp21Q9QZL6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Usp21Q9QZL6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30,16■■■□□ 2,42
Usp21Q9QZL6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Usp21Q9QZL6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Usp21Q9QZL6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Usp21Q9QZL6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Usp21Q9QZL6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
Usp21Q9QZL6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Usp21Q9QZL6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Usp21Q9QZL6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Usp21Q9QZL6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Usp21Q9QZL6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Usp21Q9QZL6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Usp21Q9QZL6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Usp21Q9QZL6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Usp21Q9QZL6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Usp21Q9QZL6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Usp21Q9QZL6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Usp21Q9QZL6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Usp21Q9QZL6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Usp21Q9QZL6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Usp21Q9QZL6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Usp21Q9QZL6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Usp21Q9QZL6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Usp21Q9QZL6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Usp21Q9QZL6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Usp21Q9QZL6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Usp21Q9QZL6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Usp21Q9QZL6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Usp21Q9QZL6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Usp21Q9QZL6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Usp21Q9QZL6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Usp21Q9QZL6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Usp21Q9QZL6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Usp21Q9QZL6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Usp21Q9QZL6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Usp21Q9QZL6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Usp21Q9QZL6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Usp21Q9QZL6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Usp21Q9QZL6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,5 ms