Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClnkQ9QZE2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClnkQ9QZE2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClnkQ9QZE2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClnkQ9QZE2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClnkQ9QZE2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClnkQ9QZE2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClnkQ9QZE2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClnkQ9QZE2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClnkQ9QZE2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClnkQ9QZE2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClnkQ9QZE2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClnkQ9QZE2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClnkQ9QZE2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClnkQ9QZE2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClnkQ9QZE2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClnkQ9QZE2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClnkQ9QZE2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClnkQ9QZE2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClnkQ9QZE2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms