Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr4a3Q9QZB6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nr4a3Q9QZB6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr4a3Q9QZB6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr4a3Q9QZB6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr4a3Q9QZB6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms