Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six6Q9QZ28 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Six6Q9QZ28 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Six6Q9QZ28 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms