Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Phtf1Q9QZ09 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Phtf1Q9QZ09 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Phtf1Q9QZ09 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Phtf1Q9QZ09 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Phtf1Q9QZ09 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Phtf1Q9QZ09 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Phtf1Q9QZ09 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Phtf1Q9QZ09 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Phtf1Q9QZ09 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Phtf1Q9QZ09 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Phtf1Q9QZ09 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Phtf1Q9QZ09 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Phtf1Q9QZ09 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Phtf1Q9QZ09 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Phtf1Q9QZ09 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Phtf1Q9QZ09 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Phtf1Q9QZ09 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Phtf1Q9QZ09 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Phtf1Q9QZ09 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phtf1Q9QZ09 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phtf1Q9QZ09 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Phtf1Q9QZ09 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Phtf1Q9QZ09 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Phtf1Q9QZ09 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phtf1Q9QZ09 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phtf1Q9QZ09 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms