Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh11Q9QYF1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh11Q9QYF1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdh11Q9QYF1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rdh11Q9QYF1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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