Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd1Q9QY80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd1Q9QY80 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd1Q9QY80 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hacd1Q9QY80 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms