Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cbx8Q9QXV1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cbx8Q9QXV1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cbx8Q9QXV1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cbx8Q9QXV1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cbx8Q9QXV1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cbx8Q9QXV1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cbx8Q9QXV1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbx8Q9QXV1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbx8Q9QXV1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cbx8Q9QXV1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx8Q9QXV1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cbx8Q9QXV1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cbx8Q9QXV1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx8Q9QXV1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms