Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcsk1nQ9QXV0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcsk1nQ9QXV0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcsk1nQ9QXV0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcsk1nQ9QXV0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms