Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXU7

Prok2, Prokineticin-2, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok2Q9QXU7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prok2Q9QXU7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prok2Q9QXU7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prok2Q9QXU7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prok2Q9QXU7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prok2Q9QXU7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prok2Q9QXU7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prok2Q9QXU7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prok2Q9QXU7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prok2Q9QXU7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prok2Q9QXU7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prok2Q9QXU7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prok2Q9QXU7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prok2Q9QXU7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prok2Q9QXU7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prok2Q9QXU7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prok2Q9QXU7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prok2Q9QXU7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prok2Q9QXU7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prok2Q9QXU7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prok2Q9QXU7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prok2Q9QXU7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms