Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChmQ9QXG2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ChmQ9QXG2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ChmQ9QXG2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChmQ9QXG2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChmQ9QXG2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms