Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Limd1Q9QXD8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Limd1Q9QXD8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Limd1Q9QXD8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Limd1Q9QXD8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Limd1Q9QXD8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Limd1Q9QXD8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Limd1Q9QXD8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Limd1Q9QXD8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Limd1Q9QXD8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Limd1Q9QXD8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Limd1Q9QXD8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Limd1Q9QXD8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Limd1Q9QXD8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Limd1Q9QXD8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Limd1Q9QXD8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Limd1Q9QXD8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Limd1Q9QXD8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Limd1Q9QXD8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Limd1Q9QXD8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Limd1Q9QXD8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Limd1Q9QXD8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Limd1Q9QXD8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms