Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Ptf1aQ9QX98 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,32
Ptf1aQ9QX98 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Ptf1aQ9QX98 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ptf1aQ9QX98 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ptf1aQ9QX98 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ptf1aQ9QX98 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Ptf1aQ9QX98 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ptf1aQ9QX98 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ptf1aQ9QX98 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ptf1aQ9QX98 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ptf1aQ9QX98 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Ptf1aQ9QX98 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Ptf1aQ9QX98 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Ptf1aQ9QX98 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,28
Ptf1aQ9QX98 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29,2■■■□□ 2,27
Ptf1aQ9QX98 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Ptf1aQ9QX98 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ptf1aQ9QX98 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms