Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trpc5Q9QX29 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trpc5Q9QX29 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Trpc5Q9QX29 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trpc5Q9QX29 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trpc5Q9QX29 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trpc5Q9QX29 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Trpc5Q9QX29 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trpc5Q9QX29 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trpc5Q9QX29 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Trpc5Q9QX29 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Trpc5Q9QX29 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Trpc5Q9QX29 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Trpc5Q9QX29 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trpc5Q9QX29 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trpc5Q9QX29 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trpc5Q9QX29 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Trpc5Q9QX29 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trpc5Q9QX29 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trpc5Q9QX29 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trpc5Q9QX29 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trpc5Q9QX29 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trpc5Q9QX29 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trpc5Q9QX29 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trpc5Q9QX29 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trpc5Q9QX29 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trpc5Q9QX29 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trpc5Q9QX29 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpc5Q9QX29 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trpc5Q9QX29 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Trpc5Q9QX29 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms