Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkl2Q9QUK0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkl2Q9QUK0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkl2Q9QUK0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl2Q9QUK0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms