Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkain4Q9JMG4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkain4Q9JMG4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkain4Q9JMG4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkain4Q9JMG4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nkain4Q9JMG4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nkain4Q9JMG4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkain4Q9JMG4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms