Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dclk1Q9JLM8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Dclk1Q9JLM8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dclk1Q9JLM8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dclk1Q9JLM8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dclk1Q9JLM8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dclk1Q9JLM8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dclk1Q9JLM8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dclk1Q9JLM8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dclk1Q9JLM8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dclk1Q9JLM8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dclk1Q9JLM8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Dclk1Q9JLM8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dclk1Q9JLM8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dclk1Q9JLM8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dclk1Q9JLM8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dclk1Q9JLM8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dclk1Q9JLM8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dclk1Q9JLM8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dclk1Q9JLM8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dclk1Q9JLM8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dclk1Q9JLM8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dclk1Q9JLM8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dclk1Q9JLM8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dclk1Q9JLM8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dclk1Q9JLM8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dclk1Q9JLM8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dclk1Q9JLM8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dclk1Q9JLM8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dclk1Q9JLM8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dclk1Q9JLM8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dclk1Q9JLM8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms