Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb1Q9JLC3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb1Q9JLC3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msrb1Q9JLC3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msrb1Q9JLC3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msrb1Q9JLC3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msrb1Q9JLC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msrb1Q9JLC3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msrb1Q9JLC3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Msrb1Q9JLC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msrb1Q9JLC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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