Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ap4m1Q9JKC7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ap4m1Q9JKC7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ap4m1Q9JKC7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms