Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ybx3Q9JKB3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Ybx3Q9JKB3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ybx3Q9JKB3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ybx3Q9JKB3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ybx3Q9JKB3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ybx3Q9JKB3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Ybx3Q9JKB3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ybx3Q9JKB3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ybx3Q9JKB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ybx3Q9JKB3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ybx3Q9JKB3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Ybx3Q9JKB3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ybx3Q9JKB3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ybx3Q9JKB3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ybx3Q9JKB3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ybx3Q9JKB3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ybx3Q9JKB3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ybx3Q9JKB3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ybx3Q9JKB3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ybx3Q9JKB3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Ybx3Q9JKB3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ybx3Q9JKB3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ybx3Q9JKB3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ybx3Q9JKB3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ybx3Q9JKB3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ybx3Q9JKB3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ybx3Q9JKB3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Ybx3Q9JKB3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ybx3Q9JKB3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ybx3Q9JKB3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ybx3Q9JKB3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ybx3Q9JKB3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ybx3Q9JKB3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ybx3Q9JKB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ybx3Q9JKB3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ybx3Q9JKB3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Ybx3Q9JKB3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ybx3Q9JKB3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ybx3Q9JKB3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ybx3Q9JKB3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ybx3Q9JKB3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ybx3Q9JKB3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ybx3Q9JKB3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ybx3Q9JKB3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ybx3Q9JKB3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ybx3Q9JKB3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ybx3Q9JKB3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ybx3Q9JKB3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ybx3Q9JKB3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ybx3Q9JKB3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ybx3Q9JKB3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ybx3Q9JKB3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ybx3Q9JKB3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Ybx3Q9JKB3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Ybx3Q9JKB3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ybx3Q9JKB3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Ybx3Q9JKB3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ybx3Q9JKB3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ybx3Q9JKB3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Ybx3Q9JKB3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ybx3Q9JKB3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ybx3Q9JKB3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ybx3Q9JKB3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ybx3Q9JKB3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms