Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK92

Hspb8, Heat shock protein beta-8, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb8Q9JK92 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hspb8Q9JK92 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hspb8Q9JK92 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hspb8Q9JK92 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hspb8Q9JK92 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms