Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tuba8Q9JJZ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tuba8Q9JJZ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tuba8Q9JJZ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba8Q9JJZ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms