Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacng4Q9JJV4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacng4Q9JJV4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacng4Q9JJV4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacng4Q9JJV4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacng4Q9JJV4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacng4Q9JJV4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacng4Q9JJV4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacng4Q9JJV4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacng4Q9JJV4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacng4Q9JJV4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacng4Q9JJV4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cacng4Q9JJV4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacng4Q9JJV4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cacng4Q9JJV4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacng4Q9JJV4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacng4Q9JJV4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacng4Q9JJV4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacng4Q9JJV4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacng4Q9JJV4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacng4Q9JJV4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacng4Q9JJV4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacng4Q9JJV4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms