Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gfra4Q9JJT2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gfra4Q9JJT2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gfra4Q9JJT2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Gfra4Q9JJT2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Gfra4Q9JJT2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Gfra4Q9JJT2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Gfra4Q9JJT2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gfra4Q9JJT2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gfra4Q9JJT2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gfra4Q9JJT2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Gfra4Q9JJT2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Gfra4Q9JJT2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Gfra4Q9JJT2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gfra4Q9JJT2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gfra4Q9JJT2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gfra4Q9JJT2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gfra4Q9JJT2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gfra4Q9JJT2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gfra4Q9JJT2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gfra4Q9JJT2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,9 ms