Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclre1aQ9JIC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dclre1aQ9JIC3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclre1aQ9JIC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dclre1aQ9JIC3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclre1aQ9JIC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclre1aQ9JIC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclre1aQ9JIC3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclre1aQ9JIC3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclre1aQ9JIC3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclre1aQ9JIC3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclre1aQ9JIC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclre1aQ9JIC3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclre1aQ9JIC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclre1aQ9JIC3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclre1aQ9JIC3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms