Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET80

Jph1, Junctophilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph1Q9ET80 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jph1Q9ET80 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jph1Q9ET80 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jph1Q9ET80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jph1Q9ET80 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jph1Q9ET80 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jph1Q9ET80 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jph1Q9ET80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jph1Q9ET80 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Jph1Q9ET80 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Jph1Q9ET80 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Jph1Q9ET80 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Jph1Q9ET80 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jph1Q9ET80 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jph1Q9ET80 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jph1Q9ET80 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jph1Q9ET80 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jph1Q9ET80 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Jph1Q9ET80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms