Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH4

Nusap1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nusap1Q9ERH4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nusap1Q9ERH4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nusap1Q9ERH4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nusap1Q9ERH4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nusap1Q9ERH4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nusap1Q9ERH4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nusap1Q9ERH4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms