Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtp4Q9ER80 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtp4Q9ER80 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtp4Q9ER80 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtp4Q9ER80 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtp4Q9ER80 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtp4Q9ER80 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtp4Q9ER80 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtp4Q9ER80 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtp4Q9ER80 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtp4Q9ER80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtp4Q9ER80 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms