Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca3a2Q9EQR4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca3a2Q9EQR4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca3a2Q9EQR4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clca3a2Q9EQR4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca3a2Q9EQR4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca3a2Q9EQR4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clca3a2Q9EQR4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca3a2Q9EQR4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca3a2Q9EQR4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms