Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf21Q9EPU5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf21Q9EPU5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf21Q9EPU5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms