Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsc1Q9EP53 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tsc1Q9EP53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsc1Q9EP53 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsc1Q9EP53 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsc1Q9EP53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsc1Q9EP53 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsc1Q9EP53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsc1Q9EP53 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsc1Q9EP53 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsc1Q9EP53 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsc1Q9EP53 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsc1Q9EP53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsc1Q9EP53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsc1Q9EP53 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsc1Q9EP53 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsc1Q9EP53 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms