Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3s1Q9DCR2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap3s1Q9DCR2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3s1Q9DCR2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3s1Q9DCR2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ap3s1Q9DCR2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ap3s1Q9DCR2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms