Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a3Q9DCP2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a3Q9DCP2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a3Q9DCP2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a3Q9DCP2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a3Q9DCP2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a3Q9DCP2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a3Q9DCP2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a3Q9DCP2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a3Q9DCP2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc38a3Q9DCP2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a3Q9DCP2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms